Gromacs MetaDump byl v Journal of Cheminformatics
V časopise Journal of Cheminformatics byl publikován nástroj Gromacs MetaDump, který automaticky anotuje výstupní soubory z MD simulací GROMACS.
Dne 4. listopadu proběhlo na Fakultě informatiky úvodní hands-on školení Metacentra, zaměřené především na studenty bioinformatiky, kteří při své práci často potřebují přístup k výkonným výpočetním zdrojům. Akce byla určena také všem, kdo se podílejí na výzkumných projektech či připravují bakalářské a diplomové práce.
Cílem školení bylo přiblížit možnosti a principy využívání národní výpočetní infrastruktury Metacentrum, která umožňuje efektivní zpracování rozsáhlých biologických a výpočetně náročných dat. Studenti si vše prakticky vyzkoušeli na příkladu analýzy sekvenačních dat z parazita Haemonchus contortus.
Školení tak studentům otevřelo cestu k samostatné práci s prostředím Metacentra a jeho využití v rámci výzkumných a akademických aktivit.
Materiály ze školení jsou volně dostupné na adrese: github.com/CESNET/metacentrum-hands-on/blob/main/2025-11_FIMUNI.md
V časopise Journal of Cheminformatics byl publikován nástroj Gromacs MetaDump, který automaticky anotuje výstupní soubory z MD simulací GROMACS.
V časopise Bioinformatics byl publikován nástroj MOLEonline, který detekuje a analyzuje tunely a póry v proteinových strukturách.