Studijní katalog

Garantka studijního programu: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Cíle studia ve studijním programu

Studijní program Bioinformatika, realizovaný ve spolupráci Přírodovědecké fakulty a Fakulty informatiky Masarykovy univerzity, je koncipován jako interdisciplinární program propojující biologii, informatiku a analytické metody. Jeho cílem je připravit odborníky schopné efektivně pracovat s biologickými daty, aplikovat pokročilé metody analýzy a vizualizace velkých datových souborů a využívat strojové učení v biologickém výzkumu.

Program klade důraz na propojení teoretických znalostí s praktickými dovednostmi. Studenti získají pevný základ v biochemii, informatice a statistice, který rozvinou v rámci specializovaných předmětů. Důležitou součástí výuky je také seznámení s klíčovými bioinformatickými nástroji, datovými formáty a etickými či právními aspekty práce s citlivými daty.

Od druhého semestru si studenti vybírají předměty jednoho ze zaměření:

• Strukturní bioinformatika a drug design,
• Sekvenční bioinformatika,
• Výpočetní systémová biologie.

Studijní program je navržen tak, aby reflektoval aktuální vývoj v oboru a umožnil studentům získat zkušenosti s nejmodernějšími technologiemi využívanými ve výzkumu a praxi. Důležitou roli hraje také mezinárodní spolupráce a propojení s aktuálními vědeckými projekty. Absolventi programu budou připraveni na uplatnění ve vědeckovýzkumných institucích, biomedicínských a farmaceutických společnostech či v oblasti datové analýzy a softwarového vývoje v bioinformatice.

Doporučené studijní plány a pravidla pro jejich sestavování

V doporučených studijních plánech jsou uvedeny vhodné kombinace předmětů a semestrální průchody, které zahrnují všechny povinné a povinně volitelné předměty studijního programu. Doporučený studijní plán rovnoměrně rozkládá studium do standardní doby dvou let a zaručuje studentům, kteří podle něj studují, splnění povinností nutných k ukončení vysokoškolského studia během standardní doby. Mezifakultní rozvrh (časová a prostorová alokace výuky předmětů pro daný semestr) je zpracován v návaznosti na doporučené studijní plány. Studenti nemusí předměty zapisovat v uvedených semestrech, avšak v tom případě pak nemusí mít zajištěn bezkolizní rozvrh zapsaných povinných a stěžejních povinně volitelných předmětů. Při sestavení studijního plánu musí student dodržet ustanovení Studijního a zkušebního řádu (SZŘ) Masarykovy univerzity a dalších platných dokumentů. Jako východisko k tvorbě studijního plánu může student využít Doporučených studijních plánů uvedených dále.

Při tvorbě a plnění studijního plánu musí studenti dodržet následující pravidla a podmínky:

• Musí do termínu konání státní závěrečné zkoušky zapsat a úspěšně ukončit všechny předměty, které jsou ve studijním programu povinné a respektovat přitom stanovené návaznosti.
• Zapsat si alespoň dvakrát předmět FI:IV106 Bioinformatics seminar (doporučeno ve druhém roce studia).
• Splnit podmínky alespoň jednoho zaměření studia.
• Získat za celé studium absolvováním povinných, povinně volitelných a volitelných předmětů nejméně 120 kreditů. Pro průběžnou kontrolu plnění předepsaných předmětů je vhodné sledovat aplikaci Kontrola průchodu studiem v ISu MU.
• Zpracovat diplomovou práci na zadané téma.
• Absolvovat úspěšně všechny součásti magisterské státní závěrečné zkoušky.

Zakončení povinných a povinně volitelných předmětů je zkouškou u přednášky, zápočtem u laboratorního cvičení a zápočtem u semináře. Zakončení volitelných předmětů si student vybírá z možných zakončení předmětu. Volitelné předměty jsou všechny předměty, které jsou na Přírodovědecké fakultě a ostatních fakultách Masarykovy univerzity v daném období vyučovány a jejichž zápis je pro studenty daného programu povolen. Student si může zapsat předmět figurující v seznamu povinně volitelných předmětů jako předmět volitelný.

Ze SZŘ bychom studentům rádi připomněli, že na všechny předměty se vztahuje povinnost registrace v období pro registraci předmětů (viz harmonogram akademického roku). Pokud tuto povinnost student nesplní, může mu být omezením kapacity předmětu znemožněn jeho zápis. Volitelný předmět, který si zaregistruje méně než pět studentů, nemusí být nabídnut k zápisu. O tom, zda bude předmět vypsán, rozhodne příslušný ředitel ústavu.

Diplomová práce

Diplomová práce je v programu Bioinformatika třísemestrální. Konkrétní témata diplomových prací jsou vypisována v Informačním systému Masarykovy univerzity v agendě Rozpisy. Student může také téma sám navrhnout ve shodě se svým potenciálním školitelem. Téma diplomové práce si musí student zvolit před začátkem druhého semestru. Zadání diplomových prací jsou registrována a archivována.

Státní závěrečná zkouška

Státní závěrečná zkouška se skládá z obhajoby závěrečné diplomové práce a ústní zkoušky ze tří odborných předmětů:

• Bioinformatické metody (PřF:CG010, PřF:C7201, PřF:C2138, PřF:C3211)
• Správa a analýza dat (FI:PV251, PřF:S4002, PřF:C3750)
• Předmět dle zvoleného zaměření (viz povinné předměty zaměření)

Předměty studijního programu

Legenda

• P – povinný předmět
• PZ – povinný předmět pro dané zaměření
• Pv – povinně volitelný předmět
• PVZ – povinně volitelný předmět pro dané zaměření
• V – volitelný předmět
• 1S, 2S, 3S, 4S – doporučený semestr pro zápis předmětu

Doporučené studijní průchody

Doporučené studijní průchody ukazují jednu z možných variant tvorby studijního plánu pro každé zaměření. Předměty typu  PV a PVZ si můžeš zvolit jiné při respektování podmínek uvedených výše.