PDBCharges byl publikován v článku
V časopise Nucleic Acids Research byl publikován nástroj PDBCharges, který poskytuje parciální atomové náboje pro proteinové struktury z Protein Data Bank.
Sedm závěrečných prací úspěšně obhájených na jaře 2024
V posledních čtrnácti dnech, kdy pomalu, ale jistě končil jarní semestr roku 2024, sedm našich kolegů úspěšně obhájilo své závěrečné práce. Všechny práce byly obhájeny na Fakultě informatiky Masarykovy univerzity.
Iveta Strnadová obhájila diplomovou práci na téma „Automation of periodic updates of the ValTrendsDB web database“. Ivetina práce byla pro výzkumnou skupinu Strukturní bioinformatika velkým přínosem, neboť spolehlivě automatizovala týdenní aktualizace databáze ValTrendsDB, čímž snížila množství ruční práce potřebné k provedení těchto aktualizací.
Martin Jediný obhájil bakalářskou práci „Replication of PDB validation server functionality in the MetaCentrum environment“. Barbora Juríčková obhájila bakalářskou práci „Nasazení systému OMERO jako součást datového workflow v laboratoři CELLIM“. Filip Kovářík obhájil bakalářskou práci „Anonymizing experimental data in the MAFIL laboratory“. Michal Oleksik obhájil bakalářskou práci „Software tools for analysis of ring 3D structure“. Róbert Randiak obhájil bakalářskou práci „Enhancing the FAIRness of Gromacs software: Adding support to extract metadata in JSON/YAML formats“. Dušan Veľký obhájil bakalářskou práci „Visualisation of tunnels in ChannelsDB using Mol*“.
Všem sedmi kolegům gratulujeme!
